Séminaire MoDaL

Nous vous invitons Ă  venir participer au sĂ©minaire MoDaL, le 11 juillet Ă  l’ISTIC salle Guernesey Ă  Rennes, de 9h30 Ă  17h.

Le projet fĂ©dĂ©rateur MoDaL, soutenu par le rĂ©seau Biogenouest, vise Ă  mieux exploiter la complĂ©mentaritĂ© des donnĂ©es hĂ©tĂ©rogĂšnes en biologie. De la gĂ©nomique humaine, de l’imagerie in-vitro ou in-vivo, sur modĂšles animaux ou vĂ©gĂ©taux, ces donnĂ©es sont aujourd’hui produites et exploitĂ©es  “en silos”. Dans ce contexte ce sĂ©minaire est une premiĂšre Ă©tape visant Ă  animer une large communautĂ© Ă  l’échelle interrĂ©gionale (Bretagne et Pays de la Loire) et Ă  produire un Ă©tat des lieux sur cette problĂ©matique.

Les inscriptions sont gratuites mais obligatoires

FORMULAIRE D’INSCRIPTION

Nous recevrons aussi 7 intervenants:

  • Catherine Faron-Zucker, laboratoire I3S, Sophia-Antipolis, « Injecting Domain Knowledge in Electronic Medical Records to Improve Hospitalization Prediction »
  • Ivan Moszer, ICM, Paris, « Towards an Integrated Environment for Neuroscience Research »
  • Alban Gaignard, Institut du Thorax, Nantes, « INEX-MED: knowledge graphs to bridge imaging and omics data »
  • Olivier Dameron, Dyliss, Rennes, « RDF-datahub for precision medicine »
  • Isabelle Corouge, NeurInfo, Rennes, « Storing neuroimaging data for research: the experience of the Neurinfo platform »
  • Natacha Perez, Empenn, Rennes, « Bridging neuroimaging standards with JSON-LD »
  • Julien Louis, Empenn, Rennes, « The ins and outs of the Shanoir database »

PROGRAMME


L’accueil de l’ISTIC se trouve au 263 Avenue GĂ©nĂ©ral Leclerc, 35000 Rennes
Il se trouve sous le préau à gauche, à gauche de la mare en entrant dans la faculté cÎté Tournebride.
Voila un plan interactif: https://www.openstreetmap.org/node/6520612019

Liste des participants
– Catherine Faron Zucker, I3S
– Ivan Moszer, ICM
– GwenaĂ«l Rabut, IGDR
– Natacha Perez, Empenn INRIA
– Guillaume Collet, CHU Rennes
– Isabelle Corouge, Empenn INRIA
– CĂ©line Le Beguec, Genscale INRIA
– Patrick Durand, IFREMER
– Olivier Collin, IRISA
– Charles Kervrann, Serpico INRIA
– Manuel Sorroche, Biogenouest
– Christian Diot, Biogenouest
– Sylvain Prigent, France-BioImaging
– Julien Louis, InriaSoft
– Bernard Gibaut, LTSI
– Christophe Heligon, IGDR
– Elise Bannier, Empenn INRIA
– Meriem Outtas, IETR VAADER
– Audrey BihouĂ©e, Platerforme BiRD
– Pierre Maurel, Empenn INRIA
– Anne Siegel, Dyliss INRIA
– Olivier Dameron, Dyliss INRIA
– Camille Maumet, Empenn INRIA
– Alban Gaignard, Institut du thorax
– AurĂ©lien Cornet, Empenn INRIA

Pour l’équipe, AurĂ©lien / aurelien.cornet@inria.fr
Animateur du projet fédérateur MoDaL

Le projet ModaL regroupe Alban Gaignard, Richard Redon Ă  l’institut du Thorax Nantes, et Camille Maumet, Olivier Dameron, Christian Barillot, Anne Siegel Ă  l’IRISA-Inria Rennes. J’en suis l’animateur Inserm pour Biogenouest. Il porte sur l’intĂ©gration et l’interrogation de donnĂ©es de neuroimagerie et de gĂ©nomique.

Biogenouest
EMPENN
DyLiSS
L’institut du thorax