Projets ciblés

ATLASea est structuré en trois Projets Ciblés qui récapitulent le flux de données, de l’océan vers une information digitalisée accessible à tous:

DIVE-Sea : coordonné par le Muséum National d’Histoire Naturelle, il assurera le prélèvement d’échantillons sur le littoral et lors d’expéditions au large et en profondeur (notamment dans des canyons méditerranéens où la vie a su se développer en l’absence de lumière),

SEQ-Sea : coordonné par France Génomique, il réalisera le séquençage de ces échantillons au Genoscope, l’objectif étant d’aboutir à des génomes de référence, c’est à-dire complets. Il assurera l’assemblage et l’annotation initiale des gènes,

BYTE-Sea : coordonné par l’Institut Français de Bioinformatique, il assurera l’amélioration et le stockage de l’annotation informatique de cet ADN pour y repérer les gènes, retracer leur histoire évolutive et leur assigner des fonctions; les génomes seront finalement stockés dans des bases de données ouvertes et accessibles à la communauté internationale.