Initiation à l’assemblage de génome

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Date / Heure
Date(s) - 10/04/2018
14 h 00 min - 17 h 30 min

Emplacement
INRIA / IRISA Rennes

Catégories


GenOuest propose une initiation à l’assemblage de génome.

Cette initiation s’adresse aux personnes n’ayant aucune expérience en assemblage des génomes et sera donc peu adaptée si vous avez déjà des notions dans ce domaine.

Cette initiation se déroulera sur une demi-journée, à INRIA/IRISA de Rennes. Elle sera constituée d’une présentation théorique des grands concepts de l’assemblage de génome, suivi d’un TP qui se fera sur le portail Galaxy. Il s’agira d’assembler un génome bactérien à l’aide de différents outils (Velvet, Velvet Optimiser et SPAdes) et d’évaluer la qualité de ces assemblages.

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