Basé sur l’application web Seek, CeSGO research-sharing est dédié au partage d’informations liées à la recherche scientifique.
Cet outil web permet de déposer du contenu et des informations lié à la recherche scientifique (publications, protocoles, projets, institutions) et de les associer à des informations expérimentales.
Le concept FAIR
FAIR = Findable, Accessible, Interoperable, and Re-usable.
L’objectif est que chaque donnée doit respecter ces quatre termes. La plate-forme répond à ces questions en liant chaque données à des informations expérimentales.
Les projets
Afin d’ajouter du contenu dans SEEK, il est nécessaire de joindre un projet.
Pendant la première connexion, l’utilisateur peut demander à se joindre à un projet existant ou bien en demander un nouveau. Veuillez noter que seul l’administrateur de SEEK peut créer un projet.
Si vous avez oublié de faire la demande, veuillez contacter le support via la fonctionnalité Seek feedback.
ISA : Investigation / Study / Assay
Le formalisme ISA est utilisé afin de décrire les expériences biologiques (métadonnées expérimentales).
Investigation
Contexte du projet
e.g. Growth control of the eukaryote cell: a systems biology study in yeast
Study
Unité de recherche
e.g. Study of the impact of changes in flux on the transcriptome under different nutrient limitations
Assay
Mesure analytique.
e.g. Protein expression profiling using mass spectrometry
e.g. Protein expression profiling using mass spectrometry
Les ‘objets’
Différents types d’objets peuvent être injectés dans SEEK.
Chaque type de donnée est liée de façon directe ou indirecte aux informations biologiques (ISA).
Les données
Les données peuvent être importés dans le système ou bien être définies par une URL ; une combinaison avec la plate-forme de données scientifique est alors possible.
Le partage
Via une gestion des autorisations complète, la recherche scientifique va pouvoir être diffusée à la communauté ; c’est l’open-data.
