BasĂ© sur lâapplication web Seek, CeSGO research-sharing est dĂ©diĂ© au partage dâinformations liĂ©es Ă la recherche scientifique.
Cet outil web permet de déposer du contenu et des informations lié à la recherche scientifique (publications, protocoles, projets, institutions) et de les associer à des informations expérimentales.
Le concept FAIR
FAIR = Findable, Accessible, Interoperable, and Re-usable.
Lâobjectif est que chaque donnĂ©e doit respecter ces quatre termes. La plate-forme rĂ©pond Ă ces questions en liant chaque donnĂ©es Ă des informations expĂ©rimentales.
Les projets
Afin dâajouter du contenu dans SEEK, il est nĂ©cessaire de joindre un projet.
Pendant la premiĂšre connexion, lâutilisateur peut demander Ă se joindre Ă un projet existant ou bien en demander un nouveau. Veuillez noter que seul lâadministrateur de SEEK peut crĂ©er un projet.
Si vous avez oublié de faire la demande, veuillez contacter le support via la fonctionnalité Seek feedback.
ISA : Investigation / Study / Assay
Le formalisme ISA est utilisé afin de décrire les expériences biologiques (métadonnées expérimentales).
Investigation
Contexte du projet
e.g. Growth control of the eukaryote cell: a systems biology study in yeast
Study
Unité de recherche
e.g. Study of the impact of changes in flux on the transcriptome under different nutrient limitations
Assay
Mesure analytique.
e.g. Protein expression profiling using mass spectrometry
e.g. Protein expression profiling using mass spectrometry
Les âobjetsâ
DiffĂ©rents types dâobjets peuvent ĂȘtre injectĂ©s dans SEEK.
Chaque type de donnée est liée de façon directe ou indirecte aux informations biologiques (ISA).
Les données
Les donnĂ©es peuvent ĂȘtre importĂ©s dans le systĂšme ou bien ĂȘtre dĂ©finies par une URL ; une combinaison avec la plate-forme de donnĂ©es scientifique est alors possible.
Le partage
Via une gestion des autorisations complĂšte, la recherche scientifique va pouvoir ĂȘtre diffusĂ©e Ă la communautĂ© ; câest lâopen-data.
