Les portails génomiques développés au sein du CATI BARIC.
Patrice Baa-Puyolet, BF2I, Villeurbanne
Sébastien Carrere, LIPME, Castanet-Tolosan
Martine Da Rocha, ISA, Sophia-Antipolis
Nicolas Lapalu, BIOGER, Palaiseau
Corinne Rancurel, ISA, Sophia-Antipolis
Stéphanie Robin, IGEPP, Le Rheu
Adeline Simon, BIOGER, Palaiseau
Amandine Velt, SVQV, Colmar

Le pipeline virAnnot: une ressource pour l’analyse de données de séquençage du virome et l’estimation automatisée de la diversité virale.
Marie Lefebvre & Thierry Candresse, BFP, Bordeaux

AskoR, un outil R pour l’analyse de données RNAseq, illustré par l’étude d’interactions complexes plante – bioagresseurs telluriques – microbiote.
Kévin Gazengel & Stéphanie Daval, IGEPP, Le Rheu

• TEGRiP, un nouvel outil pour croiser et analyser les éléments transposables et les annotations de gènes. Marie Lefebvre, BFP, Bordeaux
• Application au génome de l’abricot. Quynh-Trang Bui, BFP, Bordeaux

• Présentation d’Apollo, outil d’annotation manuelle des génomes. Anthony Bretaudeau, IGEPP, Rennes
• Une application concrète de l’annotation experte des génomes via Apollo, « Lineage-specific evolutionary changes in the CYP repertoires from four Spodoptera ». Frédérique Hilliou, Institut Sophia Agrobiotech, Sophia