DEPUIS 2023
Nous proposons des webinaires incluant la présentation d’un outil ou d’une ressource bioinformatique, accompagnée d’un exemple concret d’application dans le cadre d’un projet scientifique.
Public visé : biologistes, bioinformaticien.ne.s.
Vendredi 5 avril 2024 de 14h à 15h30 : VirAnnot
- Le pipeline virAnnot: une ressource pour l’analyse de données de séquençage du virome et l’estimation automatisée de la diversité virale.
Marie Lefebvre & Thierry Candresse, BFP, Bordeaux
Jeudi 14 décembre 2023 de 14h à 15h30 : AskoR
- AskoR, un outil R pour l’analyse de données RNAseq,
illustré par l’étude d’interactions complexes plante – bioagresseurs telluriques – microbiote.
Kévin Gazengel & Stéphanie Daval, IGEPP, Le Rheu
Jeudi 22 juin 2023 de 14h à 15h30 : TEGRIP
- TEGRiP, un nouvel outil pour croiser et analyser les éléments transposables et les annotations de gènes. Marie Lefebvre, BFP, Bordeaux
- Application au génome de l’abricot. Quynh-Trang Bui, BFP, Bordeaux
Mardi 16 mai 2023 de 14h à 15h30 : APOLLO
- Présentation d’Apollo, outil d’annotation manuelle des génomes. Anthony Bretaudeau, IGEPP, Rennes
- Une application concrète de l’annotation experte des génomes via Apollo, « Lineage-specific evolutionary changes in the CYP repertoires from four Spodoptera ». Frédérique Hilliou, Institut Sophia Agrobiotech, Sophia
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