Mettre en place une instance Galaxy, ce qu’il faut savoir

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Title	Mettre en place une instance Galaxy, ce qu’il faut savoir
Content	Tout d'abord, la façon la plus simple de déployer un serveur Galaxy est d'utiliser l'image Docker super bien maintenue avec un Galaxy complétement configuré : http://bgruening.github.io/docker-galaxy-stable/ La documentation pour administrer un serveur Galaxy : https://new.galaxyproject.org/docs/#administration - la plupart des slides les plus récentes pour se former à l'administration d'une instance Galaxy et autre sont dispo ici : https://gvlproject.github.io/dagobah-training/ La documentation pour développeurs d'outils Galaxy : https://docs.galaxyproject.org/en/latest/dev/ L'ensemble des variables utilisables dans un fichier xml de description d'outil Galaxy : https://docs.galaxyproject.org/en/latest/dev/schema.html Les infos pour ajouter un "interactive environment" : https://docs.galaxyproject.org/en/latest/dev/interactive_environments.html La documentation concernant l'API de Galaxy : https://docs.galaxyproject.org/en/latest/api_doc.html Le chat Gitter pour échanger sur les problèmes et autres : https://gitter.im/galaxyproject/Lobby
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Footnotes

Tout d'abord, la façon la plus simple de déployer un serveur Galaxy est d'utiliser l'image Docker super bien maintenue avec un Galaxy complétement configuré : http://bgruening.github.io/docker-galaxy-stable/

La documentation pour administrer un serveur Galaxy : https://new.galaxyproject.org/docs/#administration - la plupart des slides les plus récentes pour se former à l'administration d'une instance Galaxy et autre sont dispo ici : https://gvlproject.github.io/dagobah-training/
La documentation pour développeurs d'outils Galaxy : https://docs.galaxyproject.org/en/latest/dev/
- L'ensemble des variables utilisables dans un fichier xml de description d'outil Galaxy : https://docs.galaxyproject.org/en/latest/dev/schema.html
- Les infos pour ajouter un "interactive environment" : https://docs.galaxyproject.org/en/latest/dev/interactive_environments.html
La documentation concernant l'API de Galaxy : https://docs.galaxyproject.org/en/latest/api_doc.html

Le chat Gitter pour échanger sur les problèmes et autres : https://gitter.im/galaxyproject/Lobby

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Old	New	20 February 2017 at 16 h 23 min	Yvan Le Bras
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